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PDB (Protein Data Bank) é um banco de dados internacional que armazena dados de estrutura proteica. Ele fornece informações globais da estrutura da proteína, incluindo coordenadas atômicas, topologia estrutural, e outros resultados experimentais e computacionais relacionados. A base de dados do PDB é gerida e mantida conjuntamente por várias organizações de cooperação internacional.
O principal objetivo do banco de dados PDB é fornecer informações detalhadas sobre estruturas proteicas para pesquisadores científicos, biólogos e designers de medicamentos. As proteínas são moléculas cruciais nos organismos vivos, e entender sua estrutura tridimensional é crucial para entender suas funções e interações. Através do PDB, os pesquisadores podem acessar dezenas de milhares de estruturas proteicas e realizar várias análises e estudos comparativos.
Cada entrada no banco de dados do PDB representa uma estrutura proteica, que inclui descrições detalhadas das informações de sequência da proteína, estrutura topológica e composição química. Esses dados são obtidos através de técnicas experimentais, como cristalografia de raios X, ressonância magnética nuclear, etc., ou métodos de simulação computacional, como simulações de dinâmica molecular. O banco de dados PDB também fornece uma série de ferramentas e recursos para auxiliar pesquisadores na visualização estrutural, previsão funcional e design de medicamentos.