PDB

PDB (Protein Data Bank) là một cơ sở dữ liệu quốc tế lưu trữ dữ liệu cấu trúc protein. Nó cung cấp thông tin toàn cầu về cấu trúc protein, bao gồm tọa độ nguyên tử, cấu trúc liên kết và các kết quả thí nghiệm và tính toán liên quan khác. Cơ sở dữ liệu PDB được quản lý và duy trì bởi nhiều tổ chức hợp tác quốc tế.

Mục tiêu chính của cơ sở dữ liệu PDB là cung cấp thông tin chi tiết về cấu trúc protein cho các nhà nghiên cứu khoa học, nhà sinh học và nhà thiết kế dược phẩm, trong số những người khác. Protein là các phân tử quan trọng trong cơ thể sống và hiểu cấu trúc ba chiều của chúng là rất quan trọng để hiểu chức năng và tương tác của chúng. Thông qua PDB, các nhà nghiên cứu có quyền truy cập vào hàng chục nghìn cấu trúc protein và thực hiện các phân tích và nghiên cứu so sánh khác nhau.

Mỗi mục trong cơ sở dữ liệu PDB đại diện cho một cấu trúc protein bao gồm thông tin trình tự, cấu trúc liên kết và mô tả chi tiết về thành phần hóa học của protein đó. Dữ liệu thu được từ các kỹ thuật thực nghiệm (ví dụ: tinh thể học tia X, cộng hưởng từ hạt nhân, v.v.) hoặc các phương pháp mô phỏng tính toán (ví dụ: mô phỏng động lực học phân tử). Cơ sở dữ liệu PDB cũng cung cấp một loạt các công cụ và tài nguyên để giúp các nhà nghiên cứu thực hiện các công việc như trực quan hóa cấu trúc, dự đoán chức năng và thiết kế thuốc.