PDB

PDB（Protein Data Bank）は、タンパク質構造データを格納する国際的なデータベースです。原子座標、構造トポロジ、その他の関連する実験と計算結果を含む世界的なタンパク質構造情報を提供します。PDBデータベースは、複数の国際協力機構が共同で管理および維持している。

PDBデータベースの主な目標は、科学研究者、生物学者、薬物デザイナーなどにタンパク質構造の詳細な情報を提供することである。タンパク質は生体において極めて重要な分子であり、その3次元構造を理解することはその機能と相互作用を理解する上で非常に重要である。PDBを通じて、研究者は数万人のタンパク質構造にアクセスし、様々な分析と比較研究を行うことができる。

PDBデータベースの各エントリは、タンパク質の配列情報、トポロジー構造、化学組成に関する詳細な説明を含むタンパク質構造を表しています。これらのデータは、X線トランジスタ、核磁気共鳴などの実験技術、または分子動力学シミュレーションなどの計算シミュレーション方法によって得られます。PDBデータベースはまた、研究者が構造可視化、機能予測、薬物設計などの仕事を行うのを支援する一連のツールと資源を提供している。