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PDB (Protein Data Bank) est une base de données internationalisée qui stocke des données sur la structure des protéines. Il fournit des informations sur la structure des protéines à l'échelle mondiale, y compris les coordonnées atomiques, la topologie structurelle et d'autres résultats expérimentaux et informatiques pertinents. La base de données PDB est gérée et maintenue conjointement par plusieurs organisations de coopération internationale.
L'objectif principal de la base de données PDB est de fournir des informations détaillées sur la structure des protéines pour les chercheurs scientifiques, les biologistes et les concepteurs de médicaments, entre autres. Les protéines sont des molécules essentielles dans les organismes vivants et la compréhension de leur structure tridimensionnelle est importante pour comprendre leur fonction et leurs interactions. Grâce à PDB, les chercheurs peuvent accéder à des dizaines de milliers de structures protéiques et effectuer diverses études analytiques et comparatives.
Chaque entrée dans la base de données PDB représente une structure de protéine qui comprend des informations détaillées sur la séquence, la topologie et la composition chimique de cette protéine. Ces données sont obtenues soit par des techniques expérimentales (telles que la Cristallographie aux rayons X, la résonance magnétique nucléaire, etc.), soit par des méthodes de simulation computationnelle (telles que la simulation de la dynamique moléculaire). La base de données PDB fournit également une gamme d'outils et de ressources pour aider les chercheurs dans des tâches telles que la visualisation structurelle, la prédiction fonctionnelle et la conception de médicaments.
DXF (Drawing exchange format) est un format de fichier de dessin électronique initialement développé et largement utilisé par AutoCAD. Il est utilisé pour échanger et partager des données graphiques 2D et 3D entre différents logiciels de Cao (conception assistée par ordinateur).
Les fichiers DXF sont en texte brut et sont lisibles et modifiables. Il peut stocker différents types d'entités graphiques telles que des points, des lignes, des cercles, des polylignes, des polygones, des arcs de cercle, du texte, etc. En outre, DXF prend en charge le stockage des informations de métadonnées telles que les couches, les couleurs, les types de lignes, les polices, les dimensions, les définitions de blocs, les références de blocs, etc.
Comme DXF est un format de fichier ouvert, de nombreux logiciels de Cao prennent en charge l'importation et l'exportation de fichiers DXF. Cela permet l'échange mutuel de données de dessin entre les différents logiciels de Cao, facilitant ainsi la coopération et le travail collaboratif entre les concepteurs et les ingénieurs.
Dans un fichier DXF, les données graphiques sont enregistrées sous forme de code ASCII qui peut être visualisé et modifié à l'aide d'un éditeur de texte. Les fichiers DXF ont une hiérarchie structurelle claire et sont faciles à analyser et à traiter. Il est largement utilisé dans la conception mécanique, la conception architecturale, la conception de circuits et d'autres domaines, devenant une norme commune d'échange de données entre les logiciels de Cao.