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Pdb (protein data bank) es una base de datos internacional que almacena datos sobre la estructura de las proteínas. Proporciona información sobre la estructura de las proteínas a nivel mundial, incluidas coordenadas atómicas, topologías estructurales y otros resultados experimentales y computacionales relacionados. La base de datos del PDB es gestionada y mantenida conjuntamente por varias organizaciones de cooperación internacional.
El objetivo principal de la base de datos PDB es proporcionar detalles sobre la estructura de las proteínas a investigadores científicos, biólogos y diseñadores farmacéuticos, entre otros. Las proteínas son moléculas vitales en los organismos vivos y comprender su estructura tridimensional es muy importante para comprender su función e interacción. A través del pdb, los investigadores pueden acceder a decenas de miles de estructuras proteicas y realizar diversos análisis y estudios comparativos.
Cada entrada en la base de datos del pdb representa una estructura proteica que incluye una descripción detallada de la información de secuencia, la estructura topológica y la composición química de la proteína. Estos datos son obtenidos por técnicas experimentales (como Cristalografía de rayos x, resonancia magnética nuclear, etc.) o métodos de simulación computacional (como simulación de dinámica molecular). La base de datos pdb también ofrece una serie de herramientas y recursos para ayudar a los investigadores en la visualización estructural, predicción funcional y diseño de medicamentos.
El formato de archivo STL es un formato de archivo utilizado para describir objetos tridimensionales. Consiste en una serie de facetas triangulares, cada una de las cuales consta de tres vértices y un vector normal. Generalmente utilizado en la impresión 3D y el software de diseño asistido por computadora (CAD), los modelos 3D se pueden exportar al formato de archivo STL y luego al procesamiento y fabricación posteriores. El formato de archivo STL es simple y fácil de usar, por lo que se usa ampliamente en varios campos.