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PDB (Protein Data Bank) ist eine internationale Datenbank, die Proteinstrukturdaten speichert. Es liefert globale Proteinstrukturinformationen, einschließlich atomarer Koordinaten, struktureller Topologie und anderer verwandter experimenteller und rechnerischer Ergebnisse. Die PDB-Datenbank wird gemeinsam von mehreren internationalen Kooperationsorganisationen verwaltet und gepflegt.
Das Hauptziel der PDB-Datenbank ist es, Wissenschaftlern, Biologen und Medikamentendesignern detaillierte Informationen über Proteinstrukturen zur Verfügung zu stellen. Proteine sind wichtige Moleküle in lebenden Organismen, und das Verständnis ihrer dreidimensionalen Struktur ist entscheidend für das Verständnis ihrer Funktionen und Interaktionen. Über PDB können Forscher auf zehntausende Proteinstrukturen zugreifen und verschiedene Analysen und Vergleichsstudien durchführen.
Jeder Eintrag in der PDB-Datenbank stellt eine Proteinstruktur dar, die detaillierte Beschreibungen der Sequenzinformationen des Proteins, der topologischen Struktur und der chemischen Zusammensetzung enthält. Diese Daten werden durch experimentelle Techniken wie Röntgenkristallographie, Kernmagnetresonanz usw. oder computergestützte Simulationsmethoden wie Molekulardynamiksimulationen gewonnen. Die PDB-Datenbank bietet auch eine Reihe von Werkzeugen und Ressourcen, um Forschern bei Strukturvisualisierung, Funktionsvorhersage und Medikamentendesign zu helfen.
Das PLY-Format ist ein 3D-Modellformat, das ursprünglich 1994 entwickelt und veröffentlicht wurde und hauptsächlich zum Speichern von 3D-Daten von digitalen 3D-Scannern verwendet wird. Formate namens Polygon File Format und Stanford Triangle Format können binär oder textbasiert sein.
Das Dateiformat speichert 3D-Geometrieinformationen wie Scheitelpunkte, Flächen, Scheitelpunktnormalen, Farben und andere benutzerdefinierte Daten. Viele PLY-Modelle verwenden immer noch das Format und stehen zum Download bereit, und PLY-Dateien können in die beliebtesten 3D-Anwendungen wie Blender geladen werden.