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PDB (Protein Data Bank) ist eine internationale Datenbank, die Proteinstrukturdaten speichert. Es liefert globale Proteinstrukturinformationen, einschließlich atomarer Koordinaten, struktureller Topologie und anderer verwandter experimenteller und rechnerischer Ergebnisse. Die PDB-Datenbank wird gemeinsam von mehreren internationalen Kooperationsorganisationen verwaltet und gepflegt.
Das Hauptziel der PDB-Datenbank ist es, Wissenschaftlern, Biologen und Medikamentendesignern detaillierte Informationen über Proteinstrukturen zur Verfügung zu stellen. Proteine sind wichtige Moleküle in lebenden Organismen, und das Verständnis ihrer dreidimensionalen Struktur ist entscheidend für das Verständnis ihrer Funktionen und Interaktionen. Über PDB können Forscher auf zehntausende Proteinstrukturen zugreifen und verschiedene Analysen und Vergleichsstudien durchführen.
Jeder Eintrag in der PDB-Datenbank stellt eine Proteinstruktur dar, die detaillierte Beschreibungen der Sequenzinformationen des Proteins, der topologischen Struktur und der chemischen Zusammensetzung enthält. Diese Daten werden durch experimentelle Techniken wie Röntgenkristallographie, Kernmagnetresonanz usw. oder computergestützte Simulationsmethoden wie Molekulardynamiksimulationen gewonnen. Die PDB-Datenbank bietet auch eine Reihe von Werkzeugen und Ressourcen, um Forschern bei Strukturvisualisierung, Funktionsvorhersage und Medikamentendesign zu helfen.