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PDB (Protein Data Bank) è un database internazionale che memorizza i dati della struttura proteica. Fornisce informazioni sulla struttura delle proteine globali, comprese le coordinate atomiche, la topologia strutturale e altri risultati sperimentali e computazionali correlati. La banca dati PDB è gestita e gestita congiuntamente da più organizzazioni di cooperazione internazionale.
L'obiettivo principale del database PDB è quello di fornire informazioni dettagliate sulle strutture proteiche per ricercatori scientifici, biologi e progettisti di farmaci. Le proteine sono molecole cruciali negli organismi viventi e comprendere la loro struttura tridimensionale è fondamentale per comprendere le loro funzioni e interazioni. Attraverso PDB, i ricercatori possono accedere a decine di migliaia di strutture proteiche e condurre varie analisi e studi comparativi.
Ogni voce nel database PDB rappresenta una struttura proteica, che include descrizioni dettagliate delle informazioni di sequenza della proteina, della struttura topologica e della composizione chimica. Questi dati sono ottenuti attraverso tecniche sperimentali come cristallografia a raggi X, risonanza magnetica nucleare, ecc., o metodi di simulazione computazionale come simulazioni di dinamica molecolare. Il database PDB fornisce anche una serie di strumenti e risorse per assistere i ricercatori nella visualizzazione strutturale, nella previsione funzionale e nella progettazione di farmaci.